Papeža Janeza XXIII. so obtožili, da "... laže, se vdaja vsem mogočim pregreham, da je speljal papeža Bonifacija IX. na kriva pota, da je prišel v kardinalski kolegij s podkupovanjem, da je brezsrčno in slabo vladal Bologni, da je zastrupil Aleksandra V., da ni verjel niti v vstajenje niti v večno življenje, da se je predajal živalskim užitkom, da je bil zrcalo nizkotnosti in poosebljeni zlodej, da je celotno Cerkev blatil s simonijo ..." Omenjena sta bila tudi incest in sodomija, kakor tudi to, "da je najel tristo nun in imel z njimi bogoskrunske odnose; da je posilil tri sestre in zaprl v ječo neko družino, mater, sina in očeta, da jih je lahko zlorabljal". Koncil ga je nato razrešil papeške službe "kot morilca, sodomita, simonista in heretika". Vsem kristjanom je bilo naročeno, naj mu odrečejo pokorščino. Uradno je bil odstavljen 29. maja. Kmalu zatem je zares odstopil in predal papeški pečat in ribičev prstan.