Je najpogostejši vzrok za pojav nožničnega izcedka in obsega polovico vzrokov vnetja nožnice. Pojavi se, ko se podre normalno ravnotežje nožnične flore in se nekateri mikroorganizmi č ezmerno razmnožujejo. Najpogostejši znaki so homogen, moten, rumenkast nožnični izcedek neprijetnega vonja, srbenje in pekoča bolečina, pri spolno aktivnih tudi bolečina med spolnim odnosom. Dejavniki tveganja za nastanek so pretirano prhanje in raba sredstev za intimno nego, peneče se kopeli ali katera od spolno prenosljivih bolezni. Povzroči ali poslabša jo lahko tudi spolni odnos brez uporabe kondoma. Velik zdravstveni problem je velik odstotek ponavljajočih se bakterijskih vaginoz zaradi nepopolne odprave bakterij po antibiotičnem zdravljenju, osebnih dejavnikov in nezmožnosti ponovne vzpostavitve normalne laktobakterijske flore. Nezdravljena bakterijska vaginoza lahko povzroči prezgodnji porod in majhno porodno težo novorojenčkov, po porodu pa vnetje maternice. Obstaja vaginalna krema s kislim pH, ki je primerna tudi za uporabo med nosečnostjo. Brez recepta jo lahko kupite v svoji lekarni.