Vendar pa imajo vsi sistemi, ki temeljijo na takšni shemi, kar nekaj pomanjkljivosti. Ena večjih je ta, da varnost celotnega sistema temelji na varnosti ene same kartice. Če namreč uspemo razbiti varnost uporabniške kartice, se dokopljemo do vseh skupinskih ključev, zato se lahko predstavimo preostalim uporabnikom kot katerakoli skupina, ne da bi uporabnik lahko posumil, da ne komunicira s pravim članom skupine. Če pa se dokopljemo do glavnega ključa, potem lahko preprosto ponarejamo uporabniške kartice, saj si serijsko številko izmislimo, ustrezni uporabnikov ključ pa nato z glavnim ključem preprosto izračunamo. Druga pomanjkljivost je ta, da so si vse osebe znotraj ene skupine enakovredne, t.j., če uporabnik komunicira npr. z osebo iz skladišča, lahko katerakoli oseba iz skupine skladišča prisluškuje pogovoru. Poleg tega je shema povsem neuporabna, če nimamo naravne hierarhične zgradbe, ki nam omogoča delitev na skupine.