Kako marihuana učinkuje na možgane, ni natančno znano. Intoksinacija z marihuano učinkuje na številne mentalne funkcije, čutno zaznavanje, sledenje, pozornost itd. Pogosto uživanje velikih količin marihuane pri nekaterih ljudeh povzroči kronični kanabični sindrom (amotivacijski sindrom). Izraz amotivacijski sindrom se uporablja za stanje, za katerega so značilni popolno zmanjšanje učinkovitosti, apatija, zmanjšana sposobnost načrtovanja in prenašanja frustracij. Pogost naj bi bil predvsem pri mlajših ljudeh - kroničnih kadilcih, ki jih ne zanima nič več, samo še kajenje marihuane. Nekateri trdijo tudi nasprotno, da se pri človeku, ki je nagnjen k takšnemu življenjskemu slogu, ta nagnjenost najbrž preprosto še okrepi zaradi pomirjevalnih učinkov marihuane. Pomembno je, da se uživalci, ki marihuano kadijo vsak dan, nato pa jo nehajo uživati, iztrgajo iz apatije in spet najdejo kompas že po mesecu ali dveh abstinence. Ker je THC topen v lipidih in ker so membrane živčnih celic lipidi, se zdi, da lahko mamilo ostane v možganih dlje od alkohola. Nekatere raziskave kažejo, da se poškodujejo sinaptične strukture, a da bi to dokazali, bi bilo potrebno nadaljnje preučevanje.