Nevrolog postavlja diagnozo »na izločanje«. Najprej mora izločiti bolezni, ki imajo enake ali podobne simptome, končno diagnozo pa postavi šele po izvidih magnetne resonance možganov, ki pokažejo poškodbe na živčnih ovojnicah. Če jih pokaže, prav, in če jih ne? Suma na multiplo sklerozo ne more takoj ovreči, saj skener, zlasti v prvih stadijih bolezni, morda ne pokaže poškodb. Magnetna resonanca pokaže velikost, količino in porazdelitev poškodb v možganih, včasih v hrbtenjači, z njo pa lahko bolezen tudi spremljamo. Na voljo so še dopolnilni diagnostični testi, kot so merjenje hitrosti, s katero potujejo sporočila iz možganov do živcev, lumbalna punkcija in drugi. Znova je treba poudariti, da postavitev diagnoze ni začetek bolezni, ampak je bolnik z njo že preživel nekaj časa. Lahko je bil brez simptomov, lahko jih je imel, a nanje ni bil pozoren, ker so se morda pojavljali redko. Tudi po postavitvi diagnoze se lahko novi ali stari simptomi pojavijo le tu in tam, morda šele čez desetletje, kljub temu pa je bolezen navzoča.