vojni v Bosni in Hercegovini. Njegove besede v Haagu so v hrvaški javnosti močno odmevale, saj so ga desne stranke obtoževale izdajstva. Prvi Mesićev mandat ni potekal v znamenju prelomnic, značilnih za obdobje predsednika Tuđmana. Vse spremembe na hrvaškem političnem prizorišču – padcu priljubljenosti HDZ in vrnitvi levice na oblast, nato pa ponoven zasuk na parlamentarnih volitvah leta 2003, ko se je HDZ zmagoslavno vrnila – se predsednika Mesića niso pretirano dotaknile. Po prevzemu položaja je tako izstopil iz svoje stranke HNS, ustavne spremembe, sprejete septembra 2000 pa so tako precej predsednikovih pooblastil prenesle na vlado in parlament. Večjih težav s trenutno vladajočo politiko tako ni bilo. Na predsedniških volitvah februarja 2005 je Mesićevo kandidaturo podprlo kar osem strank, za las je v prvem krogu zgrešil absolutno večino, zato pa je v drugem krogu prepričljivo premagal kandidatko HDZ Jadranko Kosor in nastopil drugi predsedniški mandat, ki se bo iztekel leta 2010.