13. maja 1981 na Trgu sv. Petra v Rimu Turek Ali Agca ustreli Janeza Pavla II. Atentat se zgodi ravno na obletnico prikazovanja v Fatimi. Dejstvo, da Janez Pavel II. preživi, bo za marsikoga čudež. »Ena roka je sprožila, druga pa je vodila kroglo,« bo po okrevanju izjavil papež. Poostrijo varnostne ukrepe in pred okno papeževe sobe namestijo neprobojno steklo, Janeza Pavla II. pa bodo po svetu vozili s t. i. papamobilom. Pojavijo se špekulacije, da je atentat Alija Agce v resnici delo bolgarske in sovjetske tajne službe. Agencija TASS ga obdolži, da je veliko bolj konservativen in trd od predhodnikov. Italijane pa poziva, naj na vsedržavnem referendumu glasujejo za prepoved abortusa. V Vatikanu si z zamenjavami v vrhovih kurije zagotovi trdnejšo oblast. Vatikanologi ocenjujejo, da vlada z železno roko v žametni rokavici. Podpira delovanje skrivnostne in vplivne katoliške organizacije Opus Dei. Povzdigne jo celo na raven osebne prelature. Med obiskom Španije Opus Dei organizira navijače, ki se z avtobusi vozijo iz kraja v kraj. Leta 1984 z ZDA vzpostavi diplomatske odnose na ravni ambasadorjev. Komentarji opazovalcev so nasprotujoči si. Janez Pavel II. nima posebnih skrupul, ko se sestaja z diktatorji. Prizadeva si za varovanje okolja in opozarja na jedrsko nevarnost. Prekolne homoseksualnost. Zavrne vsako misel na možnost, da bi ukinili celibat. Poziva k miru. Tretjemu svetu daje večjo veljavo. V deželah, kjer se je pripetila demografska eksplozija, razlaga, da je kotracepcija greh. April 1987 v Čilu, na štadionu, kjer so Pinochetovi rablji zapirali in mučili ljudi, nagovori množico: »Kajne, saj zavračate idol spolnosti?« Množica glasno negoduje in je odgovorila: »Ne!«