Papež Janez Pavel II. je bil Opusu Dei zelo naklonjen, morda tudi zaradi velikega osebnega sovraštva do partijskih diktatur vzhodnega bloka in njihovega odnosa do cerkve. V njem je videl protistrup za antiklerikalizem in možnost agresivnejše oživitve cerkvene vloge v vzhodni Evropi skozi kanale politike, gospodarstva, medijev in civilne družbe. Med njegovim pontifikatom je Opus Dei postal osebna prelatura – ne glede na kraj bivanja so člani podrejeni centralnemu hierarhičnemu sistemu, na vrhu katerega je prelat z dosmrtno funkcijo. Za Benedikta XVI. pravijo, da je prvi papež povsem po meri konservativne katoliške desnice in Opusa Dei. Preden je Joseph Ratzinger, vodja kongregacije za doktrino vere, postal papež, se je oglasil tudi na elitni univerzi Opusa Dei v Navarri, kjer so mu podelili doktorat, znane pa so njegove besede: “Bog deluje zdaj in mi se mu moramo dati na voljo.”