Z vzponom sistemske biologije, genetskimi raziskavami v medicini in zadnjimi napredki biotehnologije je postala biomedicina znanstvena disciplina, ki vedno bolj temelji na računskih orodjih za iskanje znanja iz eksperimentalnih podatkov. Ker se raziskovalna paradigma ne osredotoča več na posamezne gene temveč na raziskovanje celotnega genoma hkrati, trenutno ključni pristopov v eksperimentalni biologiji temljijo na opazovanju fenotipov večjih razsežnosti. Standardni morfološki fenotipi za sistemske študije namreč ne zadoščajo več. Nove tehnike eksperimentalne biologije, razvite v preteklih letih, omogočajo opazovanje stanja organizma s pomočjo merjenja izrazov vseh genov, po potrebi tudi za več tisoč poskusnih pogojev sočasno. Glavna pridobitev takšnih fenotipov je v količini potencialne informacije, ki jo vsebujejo. Namesto študija omejenega števila učinkov zdravljenja ali opazovanja napredovanja bolezni s pomočjo določenega indikatorja posredujejo genski fenotipi veliko bogatejšo, sistemsko informacijo. Glede na to, da je tehnologija za pridobivanje takšnih fenotipov že razvita, je očitni naslednji korak razvoj računskih orodij za njihovo obdelavo. Prav to je naloga predlaganega projekta, v okviru katerega načrtujemo razvoj računskih postopkov, ki uporabljajo takšne fenotipe za analizo aktivnih komponent kemijskih učinkovin, funkcijsko genomiko in odkrivanje mehanizmov regulacije transkripcije.
Beseda | Osnovna oblika | Oblikoslovne lastnosti osnovne oblike |
---|---|---|
Z | z | predlog; orodnik |
vzponom | vzpon | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, orodnik |
sistemske | sistemski | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, rodilnik |
biologije | biologija | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, rodilnik |
genetskimi | genetski | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, množina, orodnik |
raziskavami | raziskava | samostalnik, občno ime; ženski spol, množina, orodnik |
v | v | predlog; mestnik |
medicini | medicina | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, mestnik |
in | in | priredni veznik |
zadnjimi | zadnji | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, množina, orodnik |
napredki | napredek | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, orodnik |
biotehnologije | biotehnologija | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, rodilnik |
je | biti | pomožni glagol; sedanjik, 3. oseba, ednina, nezanikani |
postala | postati | glavni glagol; dovršni, deležnik, ednina, ženski spol |
biomedicina | biomedicina | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, imenovalnik |
znanstvena | znanstven | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, imenovalnik |
disciplina | disciplina | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, imenovalnik |
ki | ki | podredni veznik |
vedno | vedno | splošni prislov; nedoločena stopnja |
bolj | bolj | splošni prislov; primernik |
temelji | temeljiti | glavni glagol; nedovršni, sedanjik, 3. oseba, ednina |
na | na | predlog; mestnik |
računskih | računski | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, srednji spol, množina, mestnik |
orodjih | orodje | samostalnik, občno ime; srednji spol, množina, mestnik |
za | za | predlog; tožilnik |
iskanje | iskanje | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, tožilnik |
znanja | znanje | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, rodilnik |
iz | iz | predlog; rodilnik |
eksperimentalnih | eksperimentalen | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, množina, rodilnik |
podatkov | podatek | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, rodilnik |
Ker | ker | podredni veznik |
se | se | povratni zaimek;, klitična naslonskost |
raziskovalna | raziskovalen | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, imenovalnik |
paradigma | paradigma | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, imenovalnik |
ne | ne | členek |
osredotoča | osredotočati | glavni glagol; nedovršni, sedanjik, 3. oseba, ednina |
več | več | členek |
na | na | predlog; tožilnik |
posamezne | posamezen | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, množina, tožilnik |
gene | gen | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, tožilnik |
temveč | temveč | priredni veznik |
na | na | predlog; tožilnik |
raziskovanje | raziskovanje | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, tožilnik |
celotnega | celoten | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, ednina, rodilnik |
genoma | genom | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, rodilnik |
hkrati | hkrati | splošni prislov; nedoločena stopnja |
trenutno | trenutno | splošni prislov; nedoločena stopnja |
ključni | ključen | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, ednina, imenovalnik, določnost=da |
pristopov | pristop | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, rodilnik |
v | v | predlog; mestnik |
eksperimentalni | eksperimentalen | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, mestnik |
biologiji | biologija | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, mestnik |
temljijo | temljiti | glavni glagol; dovršni, sedanjik, 3. oseba, množina |
na | na | predlog; mestnik |
opazovanju | opazovanje | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, mestnik |
fenotipov | fenotip | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, rodilnik |
večjih | velik | splošni pridevnik; primernik, ženski spol, množina, rodilnik |
razsežnosti | razsežnost | samostalnik, občno ime; ženski spol, množina, rodilnik |
Standardni | standarden | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, množina, imenovalnik |
morfološki | morfološki | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, množina, imenovalnik |
fenotipi | fenotip | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, imenovalnik |
za | za | predlog; tožilnik |
sistemske | sistemski | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, množina, tožilnik |
študije | študija | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, rodilnik |
namreč | namreč | priredni veznik |
ne | ne | členek |
zadoščajo | zadoščati | glavni glagol; nedovršni, sedanjik, 3. oseba, množina |
več | več | členek |
Nove | nov | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, množina, imenovalnik |
tehnike | tehnika | samostalnik, občno ime; ženski spol, množina, imenovalnik |
eksperimentalne | eksperimentalen | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, rodilnik |
biologije | biologija | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, rodilnik |
razvite | razvit | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, množina, imenovalnik |
v | v | predlog; mestnik |
preteklih | pretekel | deležniški pridevnik; nedoločena stopnja, srednji spol, množina, mestnik |
letih | leto | samostalnik, občno ime; srednji spol, množina, mestnik |
omogočajo | omogočati | glavni glagol; nedovršni, sedanjik, 3. oseba, množina |
opazovanje | opazovanje | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, tožilnik |
stanja | stanje | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, rodilnik |
organizma | organizem | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, rodilnik |
s | z | predlog; orodnik |
pomočjo | pomoč | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, orodnik |
merjenja | merjenje | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, rodilnik |
izrazov | izraz | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, rodilnik |
vseh | ves | celostni zaimek; moški spol, množina, rodilnik |
genov | gen | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, rodilnik |
po | po | predlog; mestnik |
potrebi | potreba | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, mestnik |
tudi | tudi | členek |
za | za | predlog; tožilnik |
več | več | splošni prislov; primernik |
tisoč | tisoč | glavni števnik; besedni zapis, množina, tožilnik |
poskusnih | poskusen | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, množina, rodilnik |
pogojev | pogoj | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, rodilnik |
sočasno | sočasno | splošni prislov; nedoločena stopnja |
Glavna | glaven | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, imenovalnik |
pridobitev | pridobitev | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, imenovalnik |
takšnih | takšen | kazalni zaimek; moški spol, množina, rodilnik |
fenotipov | fenotip | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, rodilnik |
je | biti | pomožni glagol; sedanjik, 3. oseba, ednina, nezanikani |
v | v | predlog; mestnik |
količini | količina | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, mestnik |
potencialne | potencialen | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, rodilnik |
informacije | informacija | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, rodilnik |
ki | ki | podredni veznik |
jo | on | osebni zaimek; 3. oseba, ženski spol, ednina, tožilnik, klitična naslonskost |
vsebujejo | vsebovati | glavni glagol; nedovršni, sedanjik, 3. oseba, množina |
Namesto | namesto | predlog; rodilnik |
študija | študij | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, rodilnik |
omejenega | omejen | deležniški pridevnik; nedoločena stopnja, srednji spol, ednina, rodilnik |
števila | število | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, rodilnik |
učinkov | učinek | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, rodilnik |
zdravljenja | zdravljenje | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, rodilnik |
ali | ali | priredni veznik |
opazovanja | opazovanje | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, rodilnik |
napredovanja | napredovanje | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, rodilnik |
bolezni | bolezen | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, rodilnik |
s | z | predlog; orodnik |
pomočjo | pomoč | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, orodnik |
določenega | določen | deležniški pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, ednina, rodilnik |
indikatorja | indikator | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, rodilnik |
posredujejo | posredovati | glavni glagol; dvovidski, sedanjik, 3. oseba, množina |
genski | genski | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, množina, imenovalnik |
fenotipi | fenotip | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, imenovalnik |
veliko | veliko | splošni prislov; nedoločena stopnja |
bogatejšo | bogat | splošni pridevnik; primernik, ženski spol, ednina, tožilnik |
sistemsko | sistemski | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, tožilnik |
informacijo | informacija | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, tožilnik |
Glede | glede | splošni prislov; nedoločena stopnja |
na | na | predlog; tožilnik |
to | ta | kazalni zaimek; srednji spol, ednina, tožilnik |
da | da | podredni veznik |
je | biti | pomožni glagol; sedanjik, 3. oseba, ednina, nezanikani |
tehnologija | tehnologija | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, imenovalnik |
za | za | predlog; tožilnik |
pridobivanje | pridobivanje | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, tožilnik |
takšnih | takšen | kazalni zaimek; moški spol, množina, rodilnik |
fenotipov | fenotip | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, rodilnik |
že | že | členek |
razvita | razvit | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, imenovalnik |
je | biti | pomožni glagol; sedanjik, 3. oseba, ednina, nezanikani |
očitni | očiten | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, ednina, imenovalnik, določnost=da |
naslednji | naslednji | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, ednina, imenovalnik, določnost=da |
korak | korak | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, imenovalnik |
razvoj | razvoj | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, imenovalnik |
računskih | računski | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, srednji spol, množina, rodilnik |
orodij | orodje | samostalnik, občno ime; srednji spol, množina, rodilnik |
za | za | predlog; tožilnik |
njihovo | njihov | svojilni zaimek; 3. oseba, ženski spol, ednina, tožilnik, množina svojine |
obdelavo | obdelava | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, tožilnik |
Prav | prav | členek |
to | ta | kazalni zaimek; srednji spol, ednina, imenovalnik |
je | biti | pomožni glagol; sedanjik, 3. oseba, ednina, nezanikani |
naloga | naloga | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, imenovalnik |
predlaganega | predlagan | deležniški pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, ednina, rodilnik |
projekta | projekt | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, rodilnik |
v | v | predlog; mestnik |
okviru | okvir | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, mestnik |
katerega | kateri | vprašalni zaimek; moški spol, ednina, rodilnik |
načrtujemo | načrtovati | glavni glagol; nedovršni, sedanjik, 1. oseba, množina |
razvoj | razvoj | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, tožilnik, živost=ne |
računskih | računski | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, množina, rodilnik |
postopkov | postopek | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, rodilnik |
ki | ki | podredni veznik |
uporabljajo | uporabljati | glavni glagol; nedovršni, sedanjik, 3. oseba, množina |
takšne | takšen | kazalni zaimek; moški spol, množina, tožilnik |
fenotipe | fenotip | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, tožilnik |
za | za | predlog; tožilnik |
analizo | analiza | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, tožilnik |
aktivnih | aktiven | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, množina, rodilnik |
komponent | komponenta | samostalnik, občno ime; ženski spol, množina, rodilnik |
kemijskih | kemijski | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, množina, rodilnik |
učinkovin | učinkovina | samostalnik, občno ime; ženski spol, množina, rodilnik |
funkcijsko | funkcijski | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, tožilnik |
genomiko | genomika | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, tožilnik |
in | in | priredni veznik |
odkrivanje | odkrivanje | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, imenovalnik |
mehanizmov | mehanizem | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, rodilnik |
regulacije | regulacija | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, rodilnik |
transkripcije | transkripcija | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, rodilnik |