Aerobno v prisotnosti zraka (kisika) razgrajujemo materiale, ki vsebujejo organske snovi. To je naraven proces, ki ga pospešimo z nastavljanjem optimalnih pogojev za razkroj odpadkov. Odpadke sortiramo, premešamo, zdrobimo in odstranimo anorganske snovi. V prebranih organskih odpadkih zagotovimo optimalno vlažnost in temperaturo, tako da mikroorganizmi naravno razgradijo organski del. Po prvi fazi kompostiranja kompost stabiliziramo z biostabilizacijo -- z dvigom temperature na 100 °C. Proces izvajamo v zaprtih prostorih, saj pri razkrajanju močno smrdi. (Po EPA letvici jakost smradu opisujemo z besedami ni zaznave, zelo šibka, šibka, izrazita, močna, zelo močna in ekstremno močna, kar označujemo z nivojem intenzivnosti od 0 do 6 OU/m3). Razširjanje smradu preprečujemo s podtlakom v prostorih, zbrani zrak (mokri) prečrpavamo skozi napravo za čiščenje plina. Prečiščeni zrak dodatno prečistimo skozi biofiltre, običajno polnjene s sekanci lesa iglavcev, lubja iglavcev in komposta. Po sanitarizaciji pod visoko temperaturo se kompost naalkali, kar prepreči nadaljnjo razgradnjo. Kompost ne ustreza pogoju za odlaganje (TOC > 5 %), čeprav ni podvržen nadaljnjemu gnitju. Pred gradnjo kompostarne moramo naročiti študijo, s katero dokažemo, da smrad ne bo presegel mejnih vrednosti; po EPA študija smradu ni potrebna, če je najmanjša razdalja med naseljem in kompostarno večja od 1000 m.