Bolezen je lahko zelo različna. Nekateri kažejo posamezne znake že kot otroci, pri drugih pa se pojavi šele po koncu dojenja. Pozneje ko se pojavi bolezen, bolj so simptomi nekarakteristični. Drugi dejavnik je tudi čas, ko se prične z uživanjem glutena in količina, ki se ga zaužije. Težave, ki se pojavijo, so lahko ali pa sploh niso povezane s prebavnim traktom. Nekateri dobijo diarejo, bolečine v trebuhu, medtem ko postanejo drugi razdražljivi in depresivni. Razdražljivost je eden od najpogostejših simptomov pri otrocih. Simptomov, ki se pojavljajo, je lahko več ali le en od navedenih: ponavljajoče napenjanje in krči v trebuhu, kronična diareja, izguba telesne teže, bledo a obilno dišeče blato, nerazjasnjena slabokrvnost, bolečine v kosteh in sklepih, spremembe obnašanja, bolečine v mišicah, krči in utrujenost, zaostala rast in zaostajanje za vrstniki, odrevenelost v nogah zaradi okvare živcev, blede obloge v ustih z ulceracijami, boleče vnetje in rdečica kože, izguba sklenine in barve zob, izguba menstruacije, slabokrvnost.