Bakterijska kromosomska DNA je precej večja molekula (nekaj 1000 kbp) od plazmidnih in fagnih molekul, ki ste jih izolirali v prejšnjih vajah. Temu je prilagojen tudi postopek izolacije. Celično steno in membrano je potrebno povsem razbiti, da se lahko kromosomska DNA sprosti iz bakterije in ves čas izolacije je potrebno paziti, da na molekule kromosomske DNA deluje čimmanj strižnih sil. Zato vzorcev ne bomo mešali na vortexu, pipetirali pa jih bomo preko odrezanih nastavkov. Po spiranju ekstracelularnega matriksa s pufrom TSE bomo razbili celično steno z lizocimom. V naslednji fazi dosežemo z dodatkom pufra GES popolno lizo celic in denaturacijo proteinov, ki jih odstranimo s fenolno ekstrakcijo.
Beseda | Osnovna oblika | Oblikoslovne lastnosti osnovne oblike |
---|---|---|
Bakterijska | bakterijski | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, imenovalnik |
kromosomska | kromosomski | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, imenovalnik |
DNA | dno | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, rodilnik |
je | biti | pomožni glagol; sedanjik, 3. oseba, ednina, nezanikani |
precej | precej | splošni prislov; nedoločena stopnja |
večja | velik | splošni pridevnik; primernik, ženski spol, ednina, imenovalnik |
molekula | molekula | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, imenovalnik |
nekaj | nekaj | splošni prislov; nedoločena stopnja |
1000 | 1000 | glavni števnik; arabski zapis |
kbp | kbpa | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, rodilnik |
od | od | predlog; rodilnik |
plazmidnih | plazmiden | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, množina, rodilnik |
in | in | priredni veznik |
fagnih | fagen | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, množina, rodilnik |
molekul | molekula | samostalnik, občno ime; ženski spol, množina, rodilnik |
ki | ki | podredni veznik |
ste | biti | pomožni glagol; sedanjik, 2. oseba, množina, nezanikani |
jih | on | osebni zaimek; 3. oseba, moški spol, množina, tožilnik, klitična naslonskost |
izolirali | izolirati | glavni glagol; dvovidski, deležnik, množina, moški spol |
v | v | predlog; mestnik |
prejšnjih | prejšnji | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, množina, mestnik |
vajah | vaja | samostalnik, občno ime; ženski spol, množina, mestnik |
Temu | ta | kazalni zaimek; srednji spol, ednina, dajalnik |
je | biti | pomožni glagol; sedanjik, 3. oseba, ednina, nezanikani |
prilagojen | prilagojen | deležniški pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, ednina, imenovalnik, določnost=ne |
tudi | tudi | členek |
postopek | postopek | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, imenovalnik |
izolacije | izolacija | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, rodilnik |
Celično | celičen | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, tožilnik |
steno | stena | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, tožilnik |
in | in | priredni veznik |
membrano | membrana | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, tožilnik |
je | biti | pomožni glagol; sedanjik, 3. oseba, ednina, nezanikani |
potrebno | potrebno | splošni prislov; nedoločena stopnja |
povsem | povsem | splošni prislov; nedoločena stopnja |
razbiti | razbiti | glavni glagol; dovršni, nedoločnik |
da | da | podredni veznik |
se | se | povratni zaimek;, klitična naslonskost |
lahko | lahko | splošni prislov; nedoločena stopnja |
kromosomska | kromosomski | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, imenovalnik |
DNA | dno | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, rodilnik |
sprosti | sprostiti | glavni glagol; dovršni, sedanjik, 3. oseba, ednina |
iz | iz | predlog; rodilnik |
bakterije | bakterija | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, rodilnik |
in | in | priredni veznik |
ves | ves | celostni zaimek; moški spol, ednina, tožilnik |
čas | čas | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, tožilnik, živost=ne |
izolacije | izolacija | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, rodilnik |
je | biti | pomožni glagol; sedanjik, 3. oseba, ednina, nezanikani |
potrebno | potrebno | splošni prislov; nedoločena stopnja |
paziti | paziti | glavni glagol; nedovršni, nedoločnik |
da | da | podredni veznik |
na | na | predlog; tožilnik |
molekule | molekula | samostalnik, občno ime; ženski spol, množina, tožilnik |
kromosomske | kromosomski | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, rodilnik |
DNA | dno | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, rodilnik |
deluje | delovati | glavni glagol; nedovršni, sedanjik, 3. oseba, ednina |
čimmanj | čimmanj | splošni prislov; nedoločena stopnja |
strižnih | strižen | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, množina, rodilnik |
sil | sila | samostalnik, občno ime; ženski spol, množina, rodilnik |
Zato | zato | priredni veznik |
vzorcev | vzorec | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, rodilnik |
ne | ne | členek |
bomo | biti | pomožni glagol; prihodnjik, 1. oseba, množina, nezanikani |
mešali | mešati | glavni glagol; nedovršni, deležnik, množina, moški spol |
na | na | predlog; mestnik |
vortexu | vortex | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, mestnik |
pipetirali | pipetirati | glavni glagol; dovršni, deležnik, množina, moški spol |
pa | pa | priredni veznik |
jih | on | osebni zaimek; 3. oseba, moški spol, množina, tožilnik, klitična naslonskost |
bomo | biti | pomožni glagol; prihodnjik, 1. oseba, množina, nezanikani |
preko | preko | predlog; rodilnik |
odrezanih | odrezan | deležniški pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, množina, rodilnik |
nastavkov | nastavek | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, rodilnik |
Po | po | predlog; mestnik |
spiranju | spiranje | samostalnik, občno ime; srednji spol, ednina, mestnik |
ekstracelularnega | ekstracelularen | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, moški spol, ednina, rodilnik |
matriksa | matriks | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, rodilnik |
s | z | predlog; orodnik |
pufrom | pufer | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, orodnik |
TSE | TSE | samostalnik, lastno ime; moški spol, ednina, imenovalnik |
bomo | biti | pomožni glagol; prihodnjik, 1. oseba, množina, nezanikani |
razbili | razbiti | glavni glagol; dovršni, deležnik, množina, moški spol |
celično | celičen | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, tožilnik |
steno | stena | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, tožilnik |
z | z | predlog; orodnik |
lizocimom | lizocim | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, orodnik |
V | v | predlog; mestnik |
naslednji | naslednji | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, mestnik |
fazi | faza | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, mestnik |
dosežemo | doseči | glavni glagol; dovršni, sedanjik, 1. oseba, množina |
z | z | predlog; orodnik |
dodatkom | dodatek | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, orodnik |
pufra | pufer | samostalnik, občno ime; moški spol, ednina, rodilnik |
GES | GES | samostalnik, lastno ime; moški spol, ednina, imenovalnik |
popolno | popoln | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, tožilnik |
lizo | liza | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, tožilnik |
celic | celica | samostalnik, občno ime; ženski spol, množina, rodilnik |
in | in | priredni veznik |
denaturacijo | denaturacija | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, tožilnik |
proteinov | protein | samostalnik, občno ime; moški spol, množina, rodilnik |
ki | ki | podredni veznik |
jih | on | osebni zaimek; 3. oseba, moški spol, množina, tožilnik, klitična naslonskost |
odstranimo | odstraniti | glavni glagol; dovršni, sedanjik, 1. oseba, množina |
s | z | predlog; orodnik |
fenolno | fenolen | splošni pridevnik; nedoločena stopnja, ženski spol, ednina, orodnik |
ekstrakcijo | ekstrakcija | samostalnik, občno ime; ženski spol, ednina, orodnik |