Vzorčenje voda – na desetih mestih – in mikrobiološke meritve kakovosti površinskih in podzemnih voda so pokazali, da so površinske vode na celotnem območju onesnažene s fekalijami, najbolj maja in junija, najbolj v potoku Brežiček pred izlivom v Obrh, najmanj pa v zajetju Kozarišče. Fizikalno-kemijska preskušanja pa so presenetila v pozitivnem smislu, zlasti v potoku Brežiček niso ugotovili pesticidov, njihovih razgradnih produktov, težkih kovin ter lahkohlapnih halogeniranih ogljikovodikov. Potrebe po vodi se bodo povečevale (z izjemo Loža, kjer je največji industrijski porabnik vode, Kovinoplastika Lož, izdelal lastno vrtino), toda izdatnost vodnih virov bo vsaj do leta 2015 ustrezala predvidenim potrebam. Rezultat študije zaščite pred poplavami je karta poplavnih območij Loške doline, Podloža in Babnega Polja, med ukrepi pa je najpomembnejše redno vzdrževanje že zgrajenih regulacij, jezov in ponorov, posek moteče zarasti ter čiščenje navlake pred požiralniki, posebej pred Golobino. Predvidena je tudi izgradnja zaščitnih nasipov in posameznih regulacij ob ogroženih naseljih. Občina Loška dolina pa je prišla tudi do dokumentacije za gradnjo kanalizacijskih sistemov. V občini, ki šteje okrog 3.730 prebivalcev, jih ima tretjina urejeno skupno odvajanje sanitarnih odpadnih voda, ostale se stekajo v greznice, ki so običajno slabo vzdrževane in neredno praznjene, poleg tega pa za strnjena naselja niso ustrezna rešitev.